Действие происходит в Академии Кросс — престижном частном учебном заведении, в неопределённый промежуток времени (примерно 1990-х — 2000-е года), который можно приблизительно определить лишь по образцам оружия и техники, встречающимся в бонусных главах манги[2] В этой академии существует два отделения — Дневное и Ночное. На Дневном учатся обычные люди, а ученики Ночного считаются элитой. Студенты Дневного класса и их преподаватели не знают, что в реальности все ученики Ночного — вампиры. Главная героиня, Юки Кросс, воспитанница директора Академии. Вместе с Зэро Кирию — другим воспитанником директора Кросса и наследником клана охотников на вампиров — они, как префекты, должны следить за порядком в Академии, по возможности пресекая все контакты между Ночным и Дневным классами, сохраняя при этом тайну вампиров.
